Syllabus – Introduction to Statistics in R (Wintersemester 2018/19)

Location / Time: CIP Pool Bio (DE.0.135), January 14-18, 2019, 10 am – 5 pm
Note that on Tuesday morning we meet in CIP-Pool VKL (VKL 5.1.14)

Contact: Lisa Hülsmann (lisa.huelsmann@ur.de)

Target group of the course: Students and PhD students of biology and similar disciplines with basic statistical knowledge (e.g. compulsory bachelor lecture for biostatics) and with little or no prior knowledge in R.

Learning objectives: The aim of the course is to be able to understand and interpret fundamental concepts of statistics; to choose the right tool among basic statistical methods for typical (biological) studies; to apply these methods in the statistic software R; to interpret the results of these analyses correctly; and to design experiments and the collection of data.

Course type / Language: Lectures, computer exercises and group work. Language of the course is English.

Certificate / Evaluation: To obtain 2 ECTS: attendance and accomplishment of a small project (analysis of a dataset) subsequent to the course. If needed, a grade can be given based on an oral exam on the project work and the basic concepts taught during the course. PhD students can obtain 1.5 ECTS for attendance only (without project) according to RIGeL rules.

Software (in case you want to use your own laptop):
• R – freely available at https://www.r-project.org/
• RStudio – freely available at https://www.rstudio.com/

Course materials:
• at GRIPS

LSF Link: https://lsf.uni-regensburg.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&publishid=123674&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfo&publishSubDir=veranstaltung

 

Vorlesung: Statistik und Bioinformatik (Wintersemester 2018/19)

Die Vorlesung führt in die grundlegenden Konzepte der Biostatistik und der Bioinformatik ein.
Den Schwerpunkt im Teil Bioinformatik bilden Verfahren zum Sequenzvergleich. Gleichzeitig werden theoretischen Grundlagen, grundlegende Konzepte der Informatik und wichtige Ergebnisse der Testtheorie vorgestellt.

Der Stoff des Biostatistikteils ist zusammengefasst im Skript “Grundlagen der Statistik”, verfügbar hier

In der letzten Vorlesungswoche am 5. und 7. Februar 2018 findet der letzte Teil (Versuchsplanung) der Veranstaltung "Design und Auswertung" statt.

Biostatistik: Einführung (Population, Stichprobe, Merkmale, Skalenarten), Wahrscheinlichkeitstheorie (Zufallsvariablen und ihre Verteilung, Spezielle Verteilungen), Schätzung unbekannter Parameter (Konfidenzintervalle), Formulieren und Prüfen von Hypothesen, Ausgewählte statistische Tests (t-Tests, Chi-Quadrat-Test), Korrelations- und Regressionsanalyse.

Bioinformatik: Sequenzvergleich, Scores und ihre Anwendung, phylogenetische Verfahren, Markov-Ketten und Modelle.

LSF Link: https://lsf.uni-regensburg.de/qisserver/rds?state=verpublish&status=init&vmfile=no&publishid=123381&moduleCall=webInfo&publishConfFile=webInfo&publishSubDir=veranstaltung